Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tgm1Q9JLF6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms