Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Scamp5Q9JKD3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms