Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Wdr61Q9ERF3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms