Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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