Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SlirpQ9D8T7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms