Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
ChtopQ9CY57 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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