Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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