Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cox6cQ9CPQ1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms