Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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