Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ssh3Q8K330 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ssh3Q8K330 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms