Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc38a2Q8CFE6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc38a2Q8CFE6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms