Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Usp27Q8CEG8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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