Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FarsaQ8C0C7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FarsaQ8C0C7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FarsaQ8C0C7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FarsaQ8C0C7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FarsaQ8C0C7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FarsaQ8C0C7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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FarsaQ8C0C7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FarsaQ8C0C7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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