Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pram1Q6BCL1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pram1Q6BCL1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms