Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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