Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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