Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifi47Q61635 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms