Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cd55bQ61476 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms