Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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