Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trim58Q5NCC9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trim58Q5NCC9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trim58Q5NCC9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim58Q5NCC9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim58Q5NCC9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim58Q5NCC9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim58Q5NCC9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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