Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rnf224Q3UIW8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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