Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd3Q3U487 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms