Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms