Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms