Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Traf3ip1Q149C2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Traf3ip1Q149C2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Traf3ip1Q149C2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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