Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem52bQ0VBF2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms