Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps8Q0P5W1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms