Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdf3Q07104 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms