Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms