Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms