Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrnp3P59055 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms