Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Cldn18P56857 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Cldn18P56857 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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