Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIRAP54198 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HIRAP54198 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms