Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms