Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc10P31257 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms