Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PdgfraP26618 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PdgfraP26618 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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