Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pou3f1P21952 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms