Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18525 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18525 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms