Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf271P15620 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms