Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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