Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms