Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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