Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20830J3KML6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm20830J3KML6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms