Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm20708H3BKF4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20708H3BKF4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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