Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms