Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Igkv1-99F6XWB2 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms