Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf169E9Q7F2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf169E9Q7F2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf169E9Q7F2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf169E9Q7F2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf169E9Q7F2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rnf169E9Q7F2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf169E9Q7F2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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