Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Kif28pD3YXS5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms