Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Phf11bB4XVQ1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Phf11bB4XVQ1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Phf11bB4XVQ1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Phf11bB4XVQ1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Phf11bB4XVQ1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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