Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otud4B2RRE7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms